Информация о случаях пневмонии, вызванной 2019-nCoV на 09.00 (мск) от 20.01.2020 г.
По состоянию на 09.00 (мск) от 20.01.2020 г. в доступных источниках опубликована следующая новая актуальная информация:
§ 19.01.20 г. около 20.00 по мск Муниципальная Комиссия здравоохранения г. Ухань опубликовала сообщение о регистрации новых случаев пневмонии, вызванной новым коронавирусом в результате тщательного скрининга медучреждений города. 18.01.20 г. зафиксировано 59 новых случаев, 19.01.20 г. – 77 случаев. Среди 136 новых заболевших – 66 мужчин и 70 женщин; возраст – от 25 до 89 лет; начало заболевания – до 18.01.20 г. В тяжёлом состоянии – 33 пациента, 3 (включая 1 с летальным исходом) – в критическом. В целом, по состоянию на 2200 19.01.2020 г. (время Китая), всего среди зарегистрированных пациентов (198 случаев) выписано 25 человек, 35 случаев - с тяжёлым течением, 9 – в критическом состоянии, 3 случая - с летальным исходом. Из 817 контактных лиц 90 остаются под наблюдением.
§ По сообщению правительственного интернет-СМИ bjnews.com 2 подтверждённых случая зарегистрированы в Пекине (район Daxing ). В настоящее время они находятся в стабильном состоянии.
§ Комиссия здравоохранения провинции Гуандун 20.01.20 г. подтвердила в сообщении на официальном сайте подтверждённый случай пневмонии в г. Шеньчжень. Мужчина 66 лет посещал родственников в Ухане, 03.01.20 г. появились лихорадка, слабость; госпитализирован 11.0120г. В настоящее время изолирован, проходит лечение.
§ 20.01.20 г. около 2.00 по мск ВОЗ в Twitter опубликовало сообщение о 139 новых случая в Ухане, Пекине и Шеньчжене.
§ По сообщению южно-корейского CDC от 20.01.20 г. в Южной Корее зарегистрирован 1 подтверждённый случай, вызванный новым коронавирусом. Известно, что женщина вернулась из г. Ухань на прошлой неделе.
§ На сайте правительства Гонконга обновлены данные о случаях с симптомами лихорадки или заболеваний дыхательных путей у лиц, прибывших из г. Ухань после 30.12.19 г. По состоянию на 12.00 от 19.01.2020 г. (время Гонконга) зарегистрировано 99 подобных пациентов, у 64 из них лабораторно подтверждены распространённые вирусные инфекции. Известно, что 76 пациентов выписано из госпиталей. С 1200 18.01.20 по 1200 19.01.20 госпитализировано 9 новых больных.
Остаётся актуальной информация, полученная ранее из официальных источников:
§ 18.01.2020 г. после 19.00 по мск Муниципальная Комиссия здравоохранения г. Ухань опубликовала сообщение об обнаружении 17 новых случаев пневмонии, вызванной новым коронавирусом в результате тщательного скрининга медучреждений города. Из 17 новых случаев - 12 мужчин и 5 женщин; 3 случая - тяжёлые. Младше 60 лет – 9 человек, старше – 8; возраст варьируется от 30 до 79 лет. Начало заболевания отмечается до 13.01.20 г.; за исключением 2 нетранспортабельных пациентов, все переведены в госпиталь Цзиньинтань.
§ На портале GISAID опубликованы геномы 2 штаммов, выделенных от завозных случаев в Таиланд. Всего опубликовано: 6 геномов – Китай, 2 – Таиланд, 1 – Япония.
§ Министерство здравоохранения Сингапура 18.01.20 сообщило об изоляции ещё одного случая пневмонии у прибывшего из г. Ухань (мужчина, 52 лет). Состояние стабильное, не посещал рынок морепродуктов. Также стало известно об отсутствии связи со вспышкой в Китае 2 ранее зарегистрированных случаев (сообщение от 17.01.20 г.).
§ 17.01.2020 г. Министерство здравоохранения Таиланда в ходе пресс-конференции подтвердило регистрацию второго завозного случая, вызванного новым коронавирусом. 13.01.20 г. в аэропорту работниками Департамента по контролю заболеваний выявлена больная 74 лет. Сейчас женщина находится в Бамраснадурском институте, состояние улучшается. Ранее госпитализированная пациентка по-прежнему изолирована.
§ 16.01.20 г. около 4.00 (по мск) Министерство здравоохранения Японии сообщило через официальный сайт о подтверждении случая заболевания, вызванного новым коронавирусом. Мужчина 30 лет, житель префектуры Канагава, прибывший из г. Ухань 6 января, на текущий момент выписан из больницы. Жалобы на температуру и кашель появились 3 января, 10 января пациент был госпитализирован. Отрицает посещение Huanan Seafood Market. Ввиду улучшения состояния выписан 15.01.20 г.; в этот же день, вечером, лабораторно подтвержден 2019-nCoV. Дополнительно получена информация о состоянии здоровья родственников пациента. Отец, проживающий с матерью больного в г. Ухань, с 28 декабря был болен пневмонией,, у матери наблюдалась лихорадка в течение одного дня (дата не указана). У жены пациента, проживающей в Японии с детьми также в течение одного дня была лихорадка (дата не указана). У детей симптомов не наблюдалось. Пациент принимал безрецептурные жаропонижающие препараты; к 9.01 температура держалась на уровне 380С, при госпитализации выявлены затемнения в лёгких. 17.01.2020 г. на сайте ВОЗ в разделе Diseases outbreak news обновлена информация о случае заболевания, вызванного новым коронавирусом, на территории Японии. Япония уведомила ВОЗ о подтверждённом случае заболевания.
§ 14.01.2020 г. на сайте ВОЗ в разделе Diseases outbreak news размещена информация о случае заболевания, вызванного новым коронавирусом, на территории Таиланда. Заболевшая, 61-летняя жительница города Ухань, не посещала рынок морепродуктов Хуанань, однако ежедневно покупала свежие морепродукты на другом местном рынке. С 5 января 2020 года отмечает лихорадку с ознобом, головную боль, боль в горле. 8 января 2020 года вылетела прямым рейсом в Таиланд из Уханя вместе с 5 членами своей семьи в составе группы из 16 туристов. В аэропорту Суварнабхуми заболевшая была выявлена с помощью тепловизорного оборудования и изолирована сотрудниками службы здравоохранения. Анализ мокроты методом ПЦР подтвердил наличие коронавируса.
§ На сайте ECDC 17.01.20 после 17.00 опубликована оценка риска для путешественников, завоза и дальнейшего распространения в ЕС. Вероятность заражения при посещении мясных рынков или рынков с живыми животными – умеренная; для избегающих подобные рынки – низкая. Вероятность завоза случаев в ЕС низкая, но такие случаи не исключены, особенно ввиду увеличения перемещений людей во время китайского нового года. Риск распространения в ЕС очень низкий.
§ Также на сайте ВОЗ в разделе Diseases outbreak news размещена информация о текущей вспышке в Китае (от 12.01.2020 г.). 11 и 12 января ВОЗ получила детальную информацию от Национальной Комиссии здравоохранения Китая. Сообщение подтверждает данные, ранее размещённые Комиссией здравоохранения г. Ухань. Китайский офис ВОЗ был уведомлён о вспышке 31.12.19 г. На данный момент факты свидетельствуют о связи вспышки с рынком морепродуктов в г. Ухань (рынок закрыт 01.01.2020 г.). Новый коронавирус был секвенирован 07.01.2020 г. Китай опубликовал секвенированный геном нового вируса 12 января. Среди медперсонала случаев заболевания не отмечено, нет признаков передачи от человека к человеку. ВОЗ не рекомендует какие-либо конкретные меры для путешественников. ВОЗ рекомендует не применять какие-либо ограничения на поездки или торговлю в Китай на основании имеющейся в настоящее время информации.
§ Дополнительно получена следующая информация. По информации, известной на 16.01.20 г. среди 41 больного преобладают мужчины (28 человек; 68.3%). Возраст пациентов варьируется от 26 до 78 лет (медианный возраст - 53 года). Начало заболевания первого известного случая – 08.12.19 г., первого случая, связанного с рынком морепродуктов – 13.12.19 г. Ежедневно с 8.12.19 по 02.01.20 г. начало заболевания отмечается у 0 - 4 человек. Пациенты с тяжёлым течением (6) приходятся на возраст от 48 до 69 лет (медианный показатель – 63.5 лет), среди них 5 мужчин и 1 женщина; время начала заболевания – с 11.12.19 г. по 01.01.20 г. Среди 41 пациента большинство связаны с рынком 27 случаев ( из них 6 также были в контакте с ранее заболевшими). Ещё 8 человек находились в контакте с ранее заболевшими, но не посещали рынок. 6 – без истории посещения рынка или контакта с зарегистрированными больными. Риск в целом остается прежним: на глобальном уровне – умеренный, в Китае – высокий.
§ Согласно информации, опубликованной 15.01.2020 г. на сайте правительства Гонконга, представители группы официальных лиц страны, посетившие накануне г. Ухань, подтвердили, что не исключена передача нового вируса от человека к человеку. Среди заражённых, связанных с рынком South China Wuhan Market и чьё состояние позволяло провести опрос, большее число были посетителями или продавцами секции морепродуктов, а не секции с мясом. Положительные на 2019-nCoV образцы из окружающей среды также собраны в секции морепродуктов. Помимо семейной пары, среди больных есть и другой случай болезни в одной семье (отец, сын и племянник, проживающие вместе), однако они работали на рынке и заболели практически одновременно. Большинство заболевших – работники рынка, 7 человек – посетители. Положительные результаты на новый коронавирус получены при исследовании земли, столешниц, перчаток, обнаруженных в секции морепродуктов.
§ Согласно сайту Муниципальнной комиссии здравоохранения г. Ухань, смерть первого пациента (61 год) зафиксирована 9.01.2020 г. Был выставлен диагноз: Пневмония тяжёлой степени. Острый респираторный дистресс-синдром. Септический шок. Полиорганная недостаточность. Цирроз печени. Непосредственной причиной смерти стала тяжёлая дыхательная недостаточность, потребовавшая применения аппарата искусственной вентиляции лёгких. Умерший был частым посетителем рынка Wuhan Seafood Market.
§ 16.01.2020 г. около 20.00 по мск Муниципальная Комиссия здравоохранения г. Ухань опубликовала сообщение о втором умершем пациенте. Мужчина 69 лет с началом заболевания 31.12.19 г. Ввиду серьёзного ухудшения состояния 4.01.20 г. госпитализирован в госпиталь Цзиньинтань. При обследовании выявлены тяжёлый миокардит (с повышением уровня кардиомаркёров более чем в 20 раз, отклонениями на ЭКГ), нарушение функции почек, полиорганная недостаточность. КТ показала фиброзные изменения в лёгких, наличие плеврального выпота, утолщение плевры (заболевший также страдал туберкулёзом.). 15 января в 00.45 пациент умер.
§ 14.01.2020 г. Муниципальная Комиссия здравоохранения г. Ухань опубликовала сообщение в формате вопрос-ответ, в котором дополняет некоторые сведения о текущей вспышке. Контактные лица гражданки г. Ухань, госпитализированной в Таиланде (подтверждённый случай, вызванный 2019-nCoV), обследованы, случаев заболевания не выявлено. В настоящее время не может быть полностью исключена возможность передачи вируса от человека к человеку. В Ухане зарегистрировано 2 больных внутри одной семьи. Мужчина, работник рынка морепродуктов Хуанань, заболел первым. Его жена, отрицающая посещение этого рынка, также заболела вслед за мужем. Большинство пациентов - мужчины, среди больных преобладают лица среднего и пожилого возраста. Пожилые пациенты с сопутствующими заболеваниями склонны к более тяжелому течению заболевания. Некоторые из заболевших отрицают посещение рынка South China Seafood Market. На рынке взяты образцы с объектов окружающей среды, часть из которых показала наличие нового коронавируса.
§ Директор Управления по контролю и профилактике заболеваний г. Ухань описал клиническую картину случаев заболевания. В основном, пациентов беспокоят лихорадка, слабость, кашель с мокротой. У небольшого количества пациентов наблюдается также одышка, снижение уровня лейкоцитов и лимфоцитов, повышение уровня печёночных ферментов, диффузные тени при рентгенологическом исследовании по типу «матового» стекла. Предполагаемый инкубационный период – до 14 дней.
§ 13.01.2020 г. на сайте Центра по контролю и профилактике заболеваний США размещена оценка риска текущей вспышки. Риск для населения США оценивается как низкий, тем не менее CDC соблюдает некоторые меры предосторожности: управление тщательно следит за ситуацией и работает с ВОЗ, сформирована отдельная группа для менеджмента ситуации, CDC будет обновлять по мере необходимости Памятку для путешественников, а также Уведомления об угрозе здравоохранению.
§ По сообщениям СМИ ресурса scmp.com в Международном аэропорте Tianhe г. Ухань установлен термометрический контроль для улетающих пассажиров.
§ На сайте https://www.gisaid.org/ исследовательской организации GISAID (партнер консорциума PREDEMICS) представлен фрагмент (369 нуклеотидов) генома вируса изолированного 14 января 2020 года от больного в префектуре Канагава (Япония). Другие сведения о геноме данного изолята пока отсутствуют. Анализ показал его 100% совпадение с соответствующими участками генома всех 6 доступных на сайте организации GISAID вариантов геномов нового вируса WuhanCoV принадлежащих к роду Бета-коронавирусов (Betacoronavirus). Сведения о имеющихся изолятах вариантов нового вируса представлены в таблице.
Также на сайте GISAID представлена информация о филогенетическом анализе 5 вариантов генома нового вируса WuhanCoV рода Бета-коронавирусов по отношению ко всем вариантам генома вирусов данного рода из генетической базы NCBI GeneBank. Далее были отобраны ближайшие по подобию к исследуемым 5 вариантам генома WuhanCoV, геномы Бета-коронавирусов (см. рисунок). Результаты анализа показывают идентичность всех 5 вариантов генома WuhanCoV между собой. Ближайшими по подобию к ним из базы NCBI GeneBank являются два генома: bat-SL-CoVZC45 (MG772933) и bat-SL-CoVZXC21 (MG772934), принадлежащие к SARS-подобным коронавирусам от летучих мышей Rhinolophussinicus.
Данный результат полностью совпадает с полученными нами ранее выводами при филогенетическом анализе генома вируса (Wuhan-Hu-1,MN908947), относящегося также к недавно открытым вариантам из рода Бета-коронавируса, выделенного от больного в декабре 2019 года в г. Ухань (Китай). По полученным нами данным геном нового коронавируса филогенетически максимально близок (идентичность 88,0 – 87,2 %)двум генома: bat-SL-CoVZC45 и bat-SL-CoVZXC21. Идентичность остальных 232 геномов рода Бета-коронавирусов из базы NCBI GeneBank к исследуемым вариантам нового вируса не превышает 82%.
Таким образом, последовательности полных геномов от 6 изолятов нового вируса WuhanCoV рода Бета-коронавирусов показывют высокую гомологию по отношению друг к другу (идентичность не менее 99,9%). Видимо, изолят вируса выделенный 14 января 2020 года от больного в префектуре Канагава (Япония), будет так же практически полностью с ними совпадать.